选择多抗还是单抗

多克隆抗体和单克隆抗体之间的功能差异在于抗体将识别的靶蛋白内表位的数量。单克隆抗体对单个表位具有特异性，而多克隆抗体是针对多个表位的抗体的异质混合物。这可以提供信号放大，增加检测稀有目标的可能性。然而，单克隆抗体利用其特异性在实验中提供更一致的结果。

下表总结了每种抗体类型的特性。

重组抗体

与天然存在的多克隆和单克隆抗体相比，重组抗体提供了进一步的改进，因为它们的基因序列是已知的并且是实验室控制的。这使得研究人员能够通过定向突变增强抗体的特异性。它还允许使用传统的蛋白质表达技术大规模生产抗体，而无需担心遗传漂变。近年来，重组抗体因其可重复性而变得越来越受欢迎。

抗体宿主种类、交叉吸附和多重分析

宿主物种是选择抗体时要考虑的另一个重要因素，特别是在使用二抗进行间接检测的情况下。至关重要的是，二抗不能与一抗的目标组织或宿主物种发生交叉反应，因为这可能会产生假阳性结果。交叉吸附二抗已经过筛选，以去除那些会发生交叉反应的抗体，使它们成为一个有吸引力的选择。

抗体宿主物种也与多重检测有关，其中样品通常在用二抗混合物检测之前用来自不同物种（和/或不同同种型）的一抗进行染色。在这种情况下，建议避免使用来自小鼠和大鼠或山羊和绵羊等密切相关物种的抗体，并确认所有抗体试剂都经过严格验证。或者，使用标记的一抗既可以缩短工作流程，又可以消除二抗交叉反应的风险。

修饰特异性抗体

蛋白质经常经历调节其功能的翻译后修饰 (PTM)，例如磷酸化、甲基化、乙酰化或糖基化。通常，这些是用修饰特异性抗体（多克隆或单克隆）检测的，这些抗体不能识别未修饰的靶蛋白。通过使用针对特定修饰的抗体，研究人员可以将实验与“总”抗体结合起来，测量修饰蛋白水平与总蛋白水平的比率。这使得能够对酶在蛋白质上放置的许多 PTM 标记进行半定量测量。