BODIPY系列染料，也常叫吡咯硼，BDP，Bodi Fluor系列，是以硼二吡咯(boron-dipyrromethene)为荧光结构母核的染料。BODIPY系列染料的主要特点是结构非对称性，这种不对称的硼二吡咯结构可以让BODIPY衍生出非常多样的结构和非常广泛的光谱范围，使它成为最常见、最实用的硼二吡咯荧光染料。多荧的BODIPY染料可覆盖所有的可见光光谱范围，与各种仪器的参数都相匹配。 和AF系列，Cy系列染料一样，硼二吡咯系列染料荧光明亮，消光系数高，光稳定性好，另外它也有自己的独特特点：比如硼二吡咯系列染料斯托克斯位移(Stokes shift)很小，光谱很窄，染料间干扰小；染料分子不带电荷，呈中性，易透膜，特别适用于透膜性探针的染料分子；另外它们的荧光在各种溶剂（包括水溶液和有机溶剂）中表现一致，适用于追踪材料表面性质，观测材料的器形细节等。
BODIPY 493/503
BODIPY 493/503染料为明亮的绿色荧光染料，荧光性质和BODIPY FL非常接近，它们两者的区别是BODIPY 493/503是对称性BODIPY染料，BODIPY FL是不对称染料。BODIPY 493/503具有较高消光系数和荧光量子产率，对溶剂极性和 pH 值的变化不敏感，是非常优异的脂溶性透膜探针染料。这里我们提供的是BODIPY 493/503的羧酸型，主要用于偶联标记反应。BODIPY 493/503还有一种无羧酸官能团的探针类染料，主要用于胞内脂粒染色。
BODIPY 493/503参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 493/503 | 500nm | 509nm | 79000 |
BODIPY 493/503 NHS 活化酯 (MAF-0030)
BODIPY FL
BODIPY FL是最简单的硼二吡咯染料，FL出自于Fluorecein(荧光素)的首二字母，意思为荧光类似荧光素。BODIPY FL激发后发明亮的绿色荧光，与荧光素，罗丹明绿，AF488等染料类似。它量子产率和消光系数很好，并且荧光属性对溶剂的极性，pH及溶剂种类不敏感，属荧光属性极稳定的一类绿色染料。BODIPY FL分子结构中性，不带电荷，整个染料分子较疏水，可透过细胞膜，常用于透膜性荧光探针(比如LysoTracker Green)。BODIPY FL的荧光寿命较长（≥ 5 ns)，可用于荧光极化类(fluorescence polarization)检查实验。
BODIPY FL参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY FL | 503 nm | 509 nm | 80000 | 0.97 |
BODIPY R6G
BODIPY R6G发黄色荧光，类似于罗丹明6G（简称R6G），故得此名。和其它硼二吡咯染料一样，BODIPY R6G量子产率，消光系数，荧光稳定性很好，并且荧光属性对溶剂的极性，pH及溶剂种类不敏感。BODIPY R6G分子中性，不带电荷，分子量较小，较疏水，可透过细胞膜，常用于透膜性荧光探针，标记细胞膜，磷脂等。BODIPY R6G也可以用来标记蛋白，多肽，纳米粒等生物材料，用于荧光显影，荧光极化(fluorescence polarization)检查，双光子实验等。
BODIPY R6G参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY R6G | 530 nm | 548 nm | 70000 | 0.96 |
BODIPY 530/550
BODIPY 530/550 染料是明亮的橙色荧光染料。它具有高消光系数和荧光量子产率，对溶剂极性和 pH 值变化相对不敏感。与高水溶性荧光基团 Alexa Fluor 488 染料和荧光素 (FITC) 不同，BODIPY 染料具有独特的疏水性，适用于染色脂质、膜和其他亲脂性化合物。BODIPY 530/550 染料具有相对较长的激发状态寿命（通常为 5 纳秒或更长），可用于基于荧光偏振的测定以及多光子激发的大型双光子截面。
BODIPY 530/550参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 530/550 | 534nm | 551nm | 77000 |
BODIPY TMR
BODIPY TMR，顾名思义为荧光类似于四甲基罗丹明（TMR）的硼二吡咯染料。BODIPY TMR激发后发明亮的橘黄色荧光，并且荧光属性很好，明亮，稳定，对溶剂的极性，pH及溶剂种类不敏感。BODIPY TMR分子结构中性，也不带电荷，整个染料分子较疏水，可透过细胞膜，常用于透膜性荧光探针。BODIPY TMR可标记有机分子，高分子，蛋白，多肽，纳米粒等生物材料，用于荧光显影，荧光极化(fluorescence polarization)检查，双光子实验等。
BODIPY TMR参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY TMR | 545 nm | 570 nm | 60000 | 0.95 |
BODIPY 558/568
BODIPY 558/568参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 558/568 | 560nm | 574nm | 84400 | 0.68 |
BODIPY 564/570
BODIPY 564/570参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 564/570 | 566nm | 576nm | 110000 | 0.74 |
BODIPY 576/589
BODIPY 576/589参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 576/589 | 580nm | 592nm | 98000 | 0.13 |
BODIPY 581/591
BODIPY 581/591参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 581/591 | 585nm | 594nm | 104000 | 0.83 |
BODIPY TR
BODIPY TR参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY TR | 589nm | 616nm | 69000 | 0.9 |
BODIPY 630/650
BODIPY 630/650参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 630/650 | 628nm | 642nm | 97000 | 0.91 |
BODIPY 650/665
BODIPY 650/665参数表
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
BODIPY 650/665 | 649nm | 667nm | 94000 | 0.52 |
