蛋白-多糖分子对接

碳水化合物参与许多重要的信号通路，碳水化合物识别是许多生物过程的关键组成部分，包括先天免疫、代谢和免疫反应。例如，位于细胞表面或分泌的生物分子中的聚糖在细胞间相互作用（包括宿主细胞与病原体之间的相互作用）中起着至关重要的作用。聚糖-蛋白质相互作用的生理和病理意义在基于结构的药物设计领域越来越受到关注。然而，由于糖基通常具有异质的化学结构和构象，利用X射线晶体学研究这些相互作用一直非常困难。计算分子建模技术为研究蛋白质-碳水化合物识别和特异性提供了一种极具吸引力的替代方法。

迈博睿生物通过结合遗传构象搜索算法和专门针对碳水化合物的经验自由能函数来预测蛋白质-碳水化合物相互作用。我们的对接程序可以系统地探索碳水化合物配体进入蛋白质腔体（与小分子结合位点相比，蛋白质腔体通常更开放且定义更不明确）的方向和位置，并评估复合物形成的自由能。实验得出的约束也可以应用于对接方案，以限制糖和蛋白质分子的搜索空间。能量函数专为碳水化合物设计，用于聚类结合位点并探索能量最有利的复合物结构。可以通过进行短时间的分子动力学模拟运行来进一步评估蛋白质配体复合物的相对稳定性。

蛋白质-碳水化合物对接过程

鉴于碳水化合物结合蛋白作为潜在药物靶点的重要性日益增强，我们的计算建模方法非常适合从原子层面理解碳水化合物识别，从而揭示蛋白质-碳水化合物复合物独有的一些分子特征。我们的方法可以预测蛋白质与单个碳水化合物配体之间的相互作用，也能预测糖基与糖基结合蛋白的结合位点和结合亲和力。

我们提供定制化服务，以满足客户的特定研究目标。如需了解更多关于蛋白质-碳水化合物对接服务的详细信息，请随时联系我们。