蛋白质与其同源配体之间的相互作用在许多重要的生物过程和代谢途径中发挥着重要作用，包括信号转导、运输、细胞调控、基因表达控制和酶抑制。目前有许多实验技术可用于检测和测量这些结合相互作用，但通过实验方法（例如X射线晶体学或核磁共振）获取复杂结构仍然困难且成本高昂。因此，计算对接被认为是研究蛋白质-配体相互作用以及药物发现和开发的重要方法。
迈博睿生物利用最先进的蛋白质-配体对接软件工具，通过计算位点、几何形状和能量来预测配体与蛋白质受体结合时的位置和方向。配体与结合位点的对接过程模拟了配体与其受体通过最低能量途径相互作用的自然过程。通常，我们的建模程序从已知结构的目标开始，例如目标蛋白质的晶体结构。然后使用对接来预测小分子与目标的结合构象和结合自由能。每个对接协议都可以描述为搜索算法和评分函数的组合。搜索算法会生成结合位点中小分子的大量姿态，从而可以充分采样蛋白质-配体系统的自由度，以包含真实的结合模式。评分函数计算特定姿势的分数或结合亲和力，代表蛋白质-配体系统相互作用的热力学，以便将真正的结合模式与所有其他探索的结合模式区分开来，并对其进行相应的排序。
蛋白质-配体对接过程
迈博睿生物将对接技术应用于多种用途。单次对接实验可用于探索蛋白质功能、研究酶抑制剂和底物以及阐明生化途径。最值得注意的是，对接技术可以应用于虚拟筛选大量可用化合物数据库，以进行先导化合物的检测和优化，这为基于结构的药物设计和发现提供了前所未有的机会。
特征
采用高效搜索算法进行并行计算，实现快速采样评分函数包括范德华力、静电力、疏水接触、氢键、表面互补性、溶剂效应等。
受体部分柔性诱导契合对接
多配体与辅因子、水、金属离子对接
结合几何分析和结合亲和力预测
虚拟筛选中的应用
我们提供定制化服务，以满足客户的特定研究目标。如需了解更多关于蛋白质-配体对接服务的详细信息，请随时联系我们。
