蛋白-脂质分子对接

膜蛋白在多种细胞功能中发挥着至关重要的作用。蛋白质附着在生物膜上，已被证实可以通过多种机制调控细胞信号转导和许多其他重要的细胞事件。体内与膜脂质的相互作用有助于稳定这些蛋白质的结构，并促进许多蛋白质结构域内的重排、组装、解离或构象变化，从而激活其生物活性。一些胞浆蛋白质通过特定的膜靶向结构域被募集到不同的细胞膜上。此外，脂质也是关键代谢途径中许多重要酶的天然底物。因此，了解蛋白质与脂质之间的相互作用至关重要。

蛋白质-脂质相互作用通过蛋白质与脂质配体之间形成的分子间氢键、范德华相互作用、疏水相互作用和离子桥（尤其是天冬氨酸或谷氨酸残基）来稳定。迈博睿生物利用最先进的计算软件工具来预测这些蛋白质-脂质相互作用。蛋白质的脂质结合位点可以通过其氨基酸序列推断，或使用分子对接方案通过其三维结构预测。我们的对接方法结合序列和结构信息，探索能量最有利的蛋白质-脂质复合物。评分函数经过专门设计，可以预测与结合事件相关的脂质变形和蛋白质构象变化。还可以应用实验得出的限制来限制搜索空间。将结合能值最高的结构聚类，并从中选择最大聚类的代表，通过能量最小化进行结构优化，然后再提交给客户。对接复合物的稳定性可以通过分子动力学模拟进一步测试。

蛋白质-脂质对接过程

研究表明，与脂质的相互作用对多种膜蛋白的结构和功能至关重要。我们的计算预测是识别蛋白质中脂质结合区域以及在原子水平上理解特定蛋白质-脂质相互作用背后的物理化学作用力的重要手段。最终预测的结构还提供了一个蛋白质/脂质相互作用的模型，可以为更详细的原子级MD模拟和/或更详细的生物物理研究奠定基础。

我们提供定制化服务，以满足客户的特定研究目标。如需了解更多关于蛋白质-脂质对接服务的详细信息，请随时联系我们。