药物设计伴随着药物化学的发展而发展。20世纪70年代后,药物设计开始综合利用药物化学、分子生物学、量子化学、统计学基本理论、现代科学技术以及电子计算机等手段,开辟了药物设计的新局面。计算机辅助药物设计(CADD)是基于计算机化学的方法,通过计算机模拟、计算和估计药物与受体生物大分子之间的关系,从而设计和优化先导化合物。
迈博睿的CADD团队已成功支持多个药物化学整合项目或单个项目。我们拥有深厚的科学素养和多年的制药行业经验,能够为客户带来更精深的专业知识和丰富的经验。
CADD 可分为基于受体或结构的药物设计 (SBDD) 和基于配体的药物设计 (LBDD)。两种方法之间的关系如下:
SBDD | LBDD | |
基于网格的 步长或随机放置 | Grid MCSS、MFS | CoMFA、COMSIA、SOMFA、MFA TopomaCoMFA |
对接 | 传统对接 DOCK、FlexX、GOLD、AutoDock、FRED、SurflexDock、Glide | 反向对接 RT-Dock |
基于特征 | 基于蛋白质的药效团或基于特征的蛋白质位点相似性/分类 | 药效团DISCO,催化剂 |
基于片段 | 片段搜索Ludi、MFS、MCSS | 图例、HQSAR、TopmaCoMFA、骨架跳跃、基于片段的相似性 |
对齐或叠加 | 基于结构或序列的蛋白质比对 | 核心结构、药效团或基于场的比对 |
基于知识 | 目标如 活性位点如 蛋白质多样性宇宙 | 药物类 铅类 多样性 |
假设模型 | 初步设计 | 假设受体模型 HASL |
我们的 CADD 服务包括:
- 基于结构的药物设计。我们可以进行分子对接、高通量虚拟筛选、新药设计、同源性建模、构象分析、定量计算等实验服务。
- 基于配体的药物设计,包括药效团建立、QSAR建立与分析、相似性搜索/聚类、R基团分解、匹配对分析、效价悬崖分析等
- 理化性质及DMPK预测,包括CYP抑制等
- 计算化学与生物信息学相关专业咨询
我们的 CADD 服务的优势:
- 药物设计的命中率高、成功率高,研发成本相对较低,研发周期短。
- 我们支持多种化学软件,包括 PyMOL、Schrodinger Drug Discovery Suite、CCG MOE、Dotmatics Vortex 和 Chemaxon Jchem Suit。
- 经验丰富的团队
如果您对我们的适体开发服务感兴趣,迈博睿生物期待与您的合作。