抗体是在我们的免疫系统中识别各种抗原的关键蛋白质。抗体越来越多地被用作诊断工具和治疗药物,而抗体工程的一个重要组成部分是获得高质量的三维结构。实验测定抗体结构非常费力,而且并非总是可行。相反,计算建模提供了一种快速且廉价的生成抗体结构模型的方法。
重链和轻链的可变区 (Fvs) 在结构建模中尤为重要,因为它们通常决定了抗体对其抗原靶标的大部分或全部特异性。抗体 Fv 区的建模涉及预测框架区 (FR) 和可变环区 (CDR)。我们的方案首先在我们精选的抗体数据库中搜索框架区 (FR) 的模板,该数据库源自蛋白质数据库 (PDB) 中公开的晶体结构。之后,根据数据库中聚集的典型环构象的同源性选择 CDR 区的模板。然后构建 Fv 区的结构模型,并细化 H3 环。也可以对包括恒定区 (Fc) 在内的整个抗体进行建模。
预测抗体结构的工作流程
迈博睿生物利用计算建模方法帮助客户预测目标抗体的三维结构。我们在各种抗体的结构建模方面拥有丰富的经验。我们构建的抗体模型均经过质量验证,可用于设计和构建具有所需治疗特性的新型抗体。
特征
高质量 3D Fv、Fab 或全抗体模型从 PDB 获取的精选抗体数据库
为重链和轻链选择单独的模板
CDR H3环路建模与细化
模型中包含抗原、配体、辅因子和水
与常见抗体编号方案兼容:Chothia、Kabat、IMGT、AHo
物理性质预测
基于模型的抗体人源化预测
我们根据客户的具体需求定制服务。如需了解更多关于抗体建模服务的详细信息,请随时联系我们。