背景
介绍
MeRIP-Seq，又称甲基化RNA免疫沉淀测序，是一种将RNA-蛋白质共免疫沉淀与高通量测序相结合的现代技术，能够提供整个转录组中RNA甲基化的详细视图。该方法有助于研究人员解析RNA甲基化的动态模式，为细胞分化、发育和疾病进展等过程提供全新的视角。迈博睿生物提供一流的MeRIP-Seq服务，旨在阐明RNA甲基化的复杂性，并推动您的研究进展。
什么是MeRIP-Seq？
MeRIP-Seq 是一种检测和测量整个转录组 RNA 甲基化的有效技术。首先，从样本中提取 RNA，并将其切成更小的片段，以便于处理。然后，使用特异抗体筛选出甲基化部分，捕获 m6A、m5C 等修饰。分离的 RNA 片段随后被构建成文库，用于高通量测序系统。最后，先进的生物信息学工具可以帮助绘制甲基化发生的位置图，测量其水平，并检测甲基化模式的任何变化。
图1. MeRIP-seq 原理图。(Cui.; et al . BMC Genomics. 2015)
MeRIP-Seq的优势
MeRIP-Seq 以其精准度和有效性脱颖而出。它使用特异性抗体结合甲基化 RNA，确保正确检测甲基化位点，避免大量错误。它覆盖整个转录组，这意味着它可以一次性检测所有 RNA，使研究人员能够发现新的甲基化位点，并了解 RNA 变化的全貌。
在测量甲基化水平方面，MeRIP-Seq 可谓精准之选，它能够更轻松地比较不同的条件，并找到甲基化强度不同的区域。通过将甲基化模式与基因活动以及细胞内发生的事件联系起来，MeRIP-Seq 揭示了 RNA 甲基化如何控制生长、应激反应和疾病演化等生物过程。
最后，MeRIP-Seq 可以轻松与其他数据收集方法（例如 RNA-Seq 和蛋白质组学）协同工作。这种协同作用有助于更深入地探究基因调控机制以及生物系统的功能。
MeRIP-Seq的应用
癌症研究
MeRIP-Seq 在研究 RNA 甲基化对癌症的影响方面发挥着至关重要的作用。它揭示了 m6A 甲基化影响的基因和通路，这些基因和通路与肿瘤的生长、扩散和抵抗治疗有关。
发育与分化：
该技术用于监测胚胎发育、组织生长以及干细胞转化为不同细胞类型早期阶段的RNA甲基化变化。它有助于深入了解m6A如何影响基因激活和细胞命运。
应激反应
MeRIP-Seq 可以发现在热休克或 DNA 损伤等应激条件下，转录组中 m6A 的变化。它揭示了 RNA 甲基化在应激条件下如何进行调节，有助于我们理解逆境中的基因调控。
基因表达调控：
通过绘制 m6A 在 RNA 上的位置，MeRIP-Seq 揭示甲基化如何影响 mRNA 的稳定性、分解、剪接和翻译。它有助于精确定位与 m6A 修饰相关的功能特征。
环状 RNA 翻译
这种方法研究环状 RNA 的甲基化及其在管理翻译中的作用，帮助我们更多地了解这些独特的 RNA 在细胞内的作用。
RNA 代谢
MeRIP-Seq 仔细研究甲基化如何影响 RNA 代谢（例如 mRNA 的稳定性、其分解以及它在细胞中的定位），以便更好地了解 RNA 在细胞功能中的作用和行为。
服务流程
MeRIP-Seq 样本要求：
- 组织：>50mg；RNA 含量低的样本需要更多的组织。
- 细胞：5×10 6 ~10 7；RNA含量低的样本需要更多的细胞。
- 总RNA：>50ug。
meRIP-Deq分析项目：
| 基本面分析 | 高级分析 |
| 移除适配器并进行质量控制 QC。 | 关联分析（使用 RNA 测序或多组学关联分析） |
| 参考基因组比对（映射） | 关联分析热图（Heatmap） |
| 富集区域识别（Peakcalling） | IGV峰值图 |
| 富集区域注释（PeakingAnno） | |
| 主题分析 | |
| Peak基因GO和KEGG分析。 | |
| 差异峰分析（差异RNA修饰mRNA、lncRNA） | |
| 差异Peak基因GO和KEGG分析。 |
可选服务：单细胞和空间转录组 MeRIP-Seq
此外，我们还提供单细胞和空间转录组 MeRIP-Seq 服务。单细胞 MeRIP-Seq 可以深入研究单个细胞中的 RNA 甲基化修饰，这对于探索细胞差异非常有用。另一方面，空间转录组 MeRIP-Seq 可以绘制出组织中 RNA 甲基化发生的位置，有助于理解组织发育和疾病机制。
优势
- 丰富的项目经验。多年MeRIP-Seq项目经验，涵盖广泛的样本类型和研究领域。
- 高质量数据。我们先进的技术平台确保高灵敏度和高特异性的测序数据。
- 专业的分析团队。一支敬业的科学家团队提供从数据到结果的深入分析。
- 定制化解决方案。根据客户需求提供个性化服务和灵活的项目设计。
- 性价比高，定价合理，确保科研预算的有效利用。
