膜蛋白建模

膜蛋白占人类基因组所有基因的三分之一，它们在细胞中作为受体、酶、离子通道和转运体发挥着至关重要的作用。由于其功能重要性，膜蛋白占据了目前50%以上的药物靶点。然而，实验结构数据稀少，主要是因为它们的过表达、重建为膜模拟物以及随后的结构测定存在困难。缺乏高分辨率结构阻碍了药物设计过程以及用于生物技术应用的具有新功能的受体的工程改造，因此人们对能够填补这一空白的计算建模工具寄予厚望。

计算结构建模是获取原子级三维膜蛋白模型的重要替代方法。随着高分辨率膜蛋白结构数量的不断增长，同源性建模程序的模板情况正在迅速改善，从而确保了最终模型的高精度。预测膜蛋白结构的工作流程与可溶性蛋白基本相同，首先将目标蛋白与选定的模板进行序列比对。在模型构建过程中，首先预测跨膜区域作为核心，并构建和完善其结构。然后预测环状构象，尤其是膜外区域的环状构象，以生成完整的模型。

膜蛋白建模流程

迈博睿将传统的同源性建模方法与几个膜蛋白特异性步骤相结合，通过避免算法中对可溶性球状蛋白的偏向性来获得更好的建模结果。在无法获得近亲蛋白质的结构信息的情况下，我们会利用远亲结构同源物来重建核心和环状区域。多年来，我们在各种膜蛋白的建模方面积累了丰富的经验，包括 G 蛋白偶联受体 (GPCR) 和转运蛋白。所有生成的结构模型均经过质量验证，可用于计算药物设计、分子动力学模拟，以及指导进一步的实验工作，例如基于结构的蛋白质工程。

我们的目标是通过膜蛋白的氨基酸序列预测其结构，其精度可与实验方法媲美，从而克服膜蛋白结构测定中的诸多难题。我们根据客户的具体需求定制服务。如需了解更多关于膜蛋白建模服务的详细信息，请随时联系我们。