背景
介绍
转录后调控对基因表达至关重要,影响着发育、分化以及细胞对环境因子的响应。它需要RNA结合蛋白 (RBP)、mRNA 以及microRNA 等非编码RNA的共同参与。这些因素都会影响RNA的剪接、RNA的出核方式、RNA在细胞内的最终定位、mRNA的降解以及翻译等过程。传统的研究这些相互作用的方法存在局限性,因此亟需更先进的技术。RIP-Seq(RNA免疫沉淀测序)技术正是这一领域的突破性进展。它可以帮助研究人员直接在活细胞中寻找和分析RBP的RNA靶标。迈博睿生物在蛋白质-核酸相互作用领域处于领先地位,并提供一流的RIP-Seq服务,帮助研究人员更深入地探究复杂的转录后调控世界。
什么是 RIP-Seq?
RIP-Seq 是一种高科技的体内方法,用于寻找与 RNA 结合蛋白 (RBP) 连接的特定 RNA。它的工作原理是利用抗体分离蛋白质和 RNA 之间自然形成的 mRNP 复合物。此步骤收集附着在 RBP 上的 RNA 分子,从而更容易地清理和分析这些 RNA 靶标。接下来,这些 RNA 片段被转化为 cDNA,并进行新一代测序,使研究人员能够全面了解 RNA-蛋白质相互作用。与传统技术相比,RIP-Seq 的优势在于它能够在自然环境中直接找到 RNA 靶标,快速处理大量数据,并且适用于不同类型的 RNA,例如 mRNA 和非编码 RNA。通过 RIP-Seq,科学家可以更好地理解基因转录后的调控机制及其表达方式。
图1. RIP-ChIP/Seq 步骤的总体方案
RIP-Seq的优势
快速 RNA 靶标发现
RIP-Seq 允许您快速识别与 RNA 结合蛋白 (RBP) 相关的特定 RNA 靶标,让您清楚地了解与特定 RBP 连接的 RNA。
更简单的实验设置
RIP-Seq 的优点之一是它不需要紫外线交联。这使得整个过程更加简单直接,有助于减少并发症并提高成功率。
可靠且敏感
RIP-Seq 能够生成高质量的数据,具有较高的信噪比,更容易准确地定位真正的 RNA-蛋白质相互作用。这确保了结果的可靠性和可重复性。
跨研究领域灵活
您可以在各个研究领域使用 RIP-Seq,无论您是研究转录后调控、识别 miRNA 靶标,还是检查 RBP 如何与非编码 RNA 相互作用。
深入的数据洞察
RIP-Seq 生成详细的数据,您可以分析这些数据来查找 RNA 靶标、进行峰识别以及运行功能富集分析。这有助于加深我们对 RNA-蛋白质相互作用生物学意义的理解。
RIP-Seq的应用
识别RNA靶点
RIP-Seq就像一个侦探工具,可以识别RNA结合蛋白的RNA伙伴,无论它们是mRNA还是非编码RNA。这有助于我们了解哪些RNA受到特定RBPs的监视。
理解转录后移动
这种方法有助于理解转录后发生的事情。它揭示了限制性结合蛋白(RBP)如何影响mRNA的稳定性、mRNA的去向以及mRNA的翻译方式。
探索非编码 RNA
RIP-Seq 帮助我们了解 RBP 和非编码 RNA(如 microRNA)如何共存,这对于基因调控极其重要。
检查 RBP 的作用
通过识别哪些 RNA 与 RBP 相关,RIP-Seq 可以帮助我们了解这些蛋白质在不同生物学功能中的作用,例如它们如何帮助发育和分化。
服务流程
- 全面的服务工作流程:
- 可交付成果:
高质量的测序数据。
关于 RNA-蛋白质相互作用的详细报告。
功能注释和通路分析。
- 其他 RIP-Seq 相关服务
全面的数据分析服务
我们提供 RIP-Seq 数据分析服务,包括差异表达和通路富集分析。此外,无论您是需要识别 RNA 靶标还是探索 RNA-蛋白质相互作用,我们都可以根据您的独特需求定制方法。
与其他组学技术的结合
我们将 RIP-Seq 与蛋白质组学和代谢组学等其他组学技术相结合,提供更全面的细胞过程图景。我们的联合分析服务将 RIP-Seq 数据与其他组学数据相结合,揭示复杂的调控网络。
优势
- RNA-蛋白质相互作用领域的专业知识。迈博睿生物在RNA-蛋白质相互作用研究方面拥有丰富的经验。我们提供高效的 RIP-Seq 及一系列相关服务。
- 彻底的分析。我们提供深入的数据分析,涵盖从质量控制和序列比对到峰值调用和功能注释的所有内容,因此您可以期待一流的结果。
- 量身定制的解决方案。迈博睿生物可以定制蛋白质-核酸相互作用的检测服务,包括 CLIP-Seq、ChIP-Seq 和 ChIRP-Seq,以帮助您进行复杂的基因表达调控研究。
- 价格优惠。我们的价格极具竞争力,丰富的专业知识也为我们的合作伙伴赢得了良好的信任。