融合蛋白建模

融合蛋白是一类由两个或多个蛋白质结构域（或序列片段）融合并整合成一个整体的蛋白质。在实验室中，研究人员通常使用重组DNA技术构建融合蛋白，以标记目标蛋白质、促进基于亲和力的蛋白质纯化、提高蛋白质溶解度和稳定性、增强连续酶反应速率以及创造创新的治疗性蛋白质。额外模块的添加赋予了融合蛋白新的功能，并通常产生具有独特整体结构的融合蛋白。

然而，蛋白质数据库 (PDB) 中并不总是能找到融合蛋白的三维结构，这阻碍了这些蛋白质的结构功能研究以及合理工程改造。结构数据的缺乏主要是由于融合蛋白（除融合小标签的蛋白质外）相对较大，以及界面或域间连接区域固有的结构异质性，这阻碍了整个蛋白质的结晶。幸运的是，在许多情况下，单个融合伴侣的结构是已知的，这些结构信息可用于指导计算建模过程。我们的结构建模程序首先选择要融合的两个蛋白质组分，它们的结构要么是已知的，要么可以使用适当选择的模板进行计算建模。然后，使用接头或域插入策略将两个融合伴侣连接起来，以创建初始融合模型。之后，通过计算采样连接融合伴侣的区域的构象来生成最终模型，这些区域的构象允许蛋白质结构域移动、旋转和相互作用，以达到稳定的构象。

预测融合蛋白结构的工作流程

迈博睿生物利用计算建模方法帮助客户预测目标融合蛋白的三维结构。我们在计算蛋白质建模技术方面拥有丰富的经验，始终确保融合蛋白的物理化学兼容性，且预测结果可在实验室中验证。所有生成的模型均经过质量验证，可用于下游计算模拟，以及设计和构建具有所需功能的新型融合蛋白。

我们提供完全定制化的服务，以满足客户的特定需求。如需了解更多关于融合蛋白建模服务的详细信息，请随时联系我们。