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三维定量构效关系

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简要描述:

治疗药物的研发是一个耗时耗力、成本高昂的过程。迄今为止,许多科学方法已被应用于药物设计,其中最流行的方法之一是计算机辅助药物设计 (CADD)。定量构效关系 (

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详细介绍

治疗药物的研发是一个耗时耗力、成本高昂的过程。迄今为止,许多科学方法已被应用于药物设计,其中最流行的方法之一是计算机辅助药物设计 (CADD)。定量构效关系 (QSAR) 建模利用计算技术,探索给定一组小分子的化学结构与生物活性之间的关系。由此产生的 QSAR 模型可用于预测新化合物的活性,包括配体与其结合位点的亲和力、抑制常数、速率常数等,这些预测基于某些结构特征或原子、基团或分子特性,例如亲脂性、极化率、电子和空间特性。 3D-QSAR作为Hansch和Free-Wilson开创的经典QSAR方法的扩展,利用配体的三维特性,使用PLS、G/PLS和ANN等稳健的化学计量学技术来预测其生物活性。该方法可以有效地指导选择需要合成的有前景的化合物,并预测这些化合物的活性,从而实现结构优化。

迈博睿生物提供 3D-QSAR 流程,使研究人员能够有效地进行力场计算,这需要训练集的三维结构(已知活性已通过实验测量)。然后,通过特征提取和后续的机器学习方法缩减创建的数据空间。我们的工作流程包括生物数据分析、生物分子三维结构优化、生物分子生物活性构象测定、分子相互作用能场计算、3D QSAR 模型生成和验证等。此一步式 3D-QSAR 工作流程旨在帮助研究人员识别小分子生物活性的决定因素,优化现有先导化合物以提高活性,并预测未经测试化合物的生物活性。

基于结构和配体的3D QSAR方案

基于结构和配体的3D QSAR方案

我们的3D-QSAR分析是一种非常有价值的药物化学工具,而来自结构生物学的不断增长的信息必将为构成3D-QSAR方法基础的假设提供宝贵的反馈。生成的QSAR模型将通过严格的交叉验证技术进行全面的内部验证以及外部验证(与客户合作)。

特征

 自动化 3D-QSAR 工作流程
 用于模型构建的强大统计技术
 改善现有先导化合物的生物活性
 预测未知化合物的活性
 对数据选择进行技术咨询,以便进行进一步处理,例如对接分析

3D-QSAR方案可根据客户的具体需求进行高度定制。如需了解更多服务详情,请随时联系我们。


 


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