香豆素（Coumarin）具有苯并吡喃酮结构，它是一大类存在于植物界中的香豆素类化合物的母核。荧光是香豆素一个特有的物理性质，在紫外光下，常显蓝色荧光。在7-位引入推电子基团（比如氨基）后，可使荧光加强；在3- or 4-位引入拉电子基团（比如羧酸基）后也能增强荧光。香豆素本身荧光较弱，引入这些基团后增加了分子内电荷转移（intranolecular charge transfer）机率，荧光增强，即使在可见光下，也能观察到荧光。另外，在3- or 4-位引入官能团也可以控制香豆素荧光的激发波长和发射波长，调节荧光颜色，比如，Coumarin 6和Coumarin 545可以发绿色荧光。
香豆素类荧光染料分子量很小，可紫外激发，一般发蓝色荧光（emission range ~410 to 470 nm），常常作为多色荧光靶标实验中蓝光染料。由于价格便宜，个头小，香豆素类染料常常用于标记酶底物，从而可在细胞中，溶液中检测酶活性。
AMCA
AMCA，有时也叫7-AMCA，是7-Amino-4-methylcoumarin acetate的缩写，是一种常用的发蓝色荧光的香豆素类染料。AMCA的优点包括分子量小，结构简单，斯托克斯位移（Stokes shift）大等。AMCA常常用于多色荧光标记实验，可以和很多染料合用，因为它的荧光发射谱和常用绿色荧光染料及更长波长的染料重叠小，干扰很少。另外需要指出的是AMCA的荧光不是很强（蓝色荧光通性），而且较易光漂白，不适合检查丰度很低的靶标。如需水溶性AMCA，可选择磺化AMCA，即AF350。
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
AMCA | 350 nm | 452 nm | 19000 | / | / | / |
Coumarin 343
Coumarin 343有时也叫C343; Coumarin 519; Coumarine 343等。它荧光母核的的CAS注册号是55804-65-4。由于母核的环化结构，Coumarin 343发蓝绿色荧光，峰值在480 nm左右。这个荧光峰值和荧光素，AF488等染料的激发峰接近，因此在荧光共振能量转移(FRET)中Coumarin 343常常作为这些染料的供体分子。
激发峰(Ex) | 发射峰(Em) | 消光系数(εmax) | 量子产率(Φ) | 分配系数(log P) | 水溶性(PBS) | |
Coumarin 343 | 437 nm | 477 nm | 39000 | 0.63 |
