蛋白质降解在细胞活动中起着重要作用，是蛋白质质量控制和细胞存活所必需的翻译后修饰。在真核细胞中，蛋白酶体或溶酶体是蛋白质降解的主要位点。蛋白酶体能够识别并分解错误折叠的蛋白质，并且它们具有明确的几何结构蛋白水解催化中心，可以分解蛋白质并产生特定长度的肽段，这些肽段随后可被胞浆氨基肽酶进一步裂解成氨基酸。
溶酶体是膜结合的细胞器样结构，内含各种蛋白酶，负责降解蛋白质聚集体和膜蛋白。待降解的蛋白质通过例如ATG/信号/调节系统被转运至溶酶体，随后由在溶酶体中成熟并激活的内切蛋白酶催化蛋白水解。溶酶体氨基肽酶和羧肽酶继续将肽分解为氨基酸和其他产物（例如糖和胆固醇）。当细胞面临营养受限等压力时，这一降解过程对于细胞生存至关重要。
蛋白质降解可以用基于放射性的方法进行研究，这种方法可以提供总体信息。关于单个蛋白质降解步骤的信息可以通过对单个模型蛋白质/肽和蛋白酶进行体外实验来获得。然而，值得注意的是，体外实验无法真实反映体内情况。由于蛋白质降解发生得太快，难以进行分析，因此在体内检测细胞整体蛋白质降解的可能性较小。
服务
作为蛋白质研究专家，迈博睿生物开发了基于质谱（MS）的方法来研究蛋白质组范围内的蛋白质降解。我们的技术平台由经验丰富的研究人员和先进的设备组成，能够获取多方面的信息，通过使用高精度串联质谱（即MS/MS）对蛋白质降解中间肽进行测序，从而在蛋白质组尺度上分析蛋白质降解。此外，我们还可以鉴定各种长度和末端具有预期/非预期翻译后修饰的肽段，识别肽段的来源，检查肽段的蛋白质来源及其亚细胞定位等，从而获得更详细的信息，从而更深入地了解蛋白质降解的分子机制和过程。
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