背景
介绍
ChIP-seq 是一种常用的方法,它很大程度上依赖于针对每种目标蛋白的正确抗体,而这些抗体可能很难获得,尤其是对于存在于鲜为人知的生物体中或含量较低的蛋白。该过程本身复杂且耗时,通常无法生成最高质量的数据。DAP-seq(DNA 亲和纯化测序)已成为有效解决这些问题的更佳替代方案。
DAP-seq 的优势(与 ChIP-seq 相比,DAP-seq 具有几个关键优势)
- 高通量:您可以同时深入研究大量转录因子的结合位点。效率极高!
- 无需抗体:无需担心寻找特定抗体,这使得处理不同物种和蛋白质变得更加容易。
- 保留修改:它保留组织或细胞系中的那些特殊调整,因此您可以了解真实世界中正在发生的事情。
- 经济高效:非常适合需要关注预算的大型项目 - 它不会花费您一大笔钱!
什么是 DAP-seq?
DAP-seq 是一种无需特定抗体即可绘制基因组中转录因子结合位点的方法。它结合了体外蛋白质表达和高通量测序,使其更易于获取且成本更低。通过使表达的蛋白质与 DNA 片段结合,DAP-seq 可以有效地识别结合位点,尤其适用于研究植物等物种的转录因子,因为在这些物种中获取合适的抗体可能较为困难。
图1. DAP-seq 协议概述(Bartlett,A.;et al . 2017)
DAP-seq的应用
- 寻找转录因子点:使用它来查找转录因子在基因组上的位置并弄清楚它们的作用。
- 检查组蛋白变化:观察某些 DNA 点上的不同组蛋白修饰,并了解它们如何影响基因表达。
- 绘制基因网络图:制作调控元件的详细图谱,以了解基因网络的控制方式。
- 了解疾病:通过观察奇怪的结合位点以及转录因子如何影响基因表达,深入了解转录因子如何在疾病中发挥作用。
服务流程
作为蛋白质-核酸相互作用研究的专家,迈博睿生物的DAP-seq技术平台能够高通量创建全基因组结合位点图,并高效分析基因组DNA文库中的修饰对转录因子结合的影响。
交付成果
- 高通量测序原始数据
- 详细的生物信息学分析报告
- 转录因子结合基序序列
您只需提供待测材料的转录因子序列和基因组样本,迈博睿生物将为您完成 DAP-seq 服务,提供全面的数据和切实可行的见解。
如果您正在研究转录因子结合位点、组蛋白变化或基因调控网络,我们的 DAP-seq 服务能够满足您的一切需求。凭借我们丰富的专业知识和尖端技术,我们定能为您的研究提供一流的结果。
优势
- 专业知识和经验:迈博睿生物的员工对核酸-蛋白质相互作用非常了解,因此您可以确保获得出色的结果。
- 高通量和高效:我们的设置让您可以快速彻底地绘制出整个基因组中的转录因子结合位点。
- 定制解决方案:我们可以调整我们的服务以满足您的需求,无论是构建载体还是进行生物信息学分析。
- 有竞争力的价格:我们公平的价格和深厚的专业知识使我们成为全球合作伙伴的首选合作伙伴。